دروس تخصصی در کانون علم و دین شامل تمامی رشته های مرتبط با دو مقوله علم و دین می‌باشد.

دروس تخصصی توسط اساتید کانون بصورت خصوصی و جهت تربیت اعضاء وابسته و پیوسته کانون علم و دین می‌باشد. افراد غیر عضو می‌توانند با ثبت نام در کانون علم و دین از مطالب استفاده نمایند.

درس‌های خارج فقه و اصول و فلسفه و عرفان توسط استاد علوی و یا تحت اشراف نظر ایشان برگزار می‌گردد. رشته های دیگر مرتبط با دو مقوله علم و دین، توسط اساتید مدعو یا اساتید عضو کانون تدریس می‌گردد.

کلاس‌ها و انجمن‌های علمی در سه شاخه آموزش، پژوهش، انتشارات فعالیت می‌کنند.